质谱和数据分析的进展为全面研究复杂生物系统中的蛋白质表达提供了新的范式 。自 2015 年以来,Cytomics 一直为蛋白质和蛋白质组分析提供质谱服务 今天,我们利用高灵敏度和准确的定量 MS 仪器和平台对最复杂的生物系统进行全面调查。我们可以研究可能由疾病状态、状况、治疗或刺激的变化带来的关键生物学途径的改变。我们访问此质谱 平台并与工业界、学术界和政府组织的研究人员密切合作 以支持跨化学和生物科学、生物医学和健康、食品的多学科项目农业和微生物学。
技术
ThermoFisher Orbitrap 平台 为所有项目配备纳米级液相色谱系统。这是许多学术思想领袖采用的行业领先仪器。
Q Exactive HF-X 混合四极杆-Orbitrap质谱仪 将高场 Thermo Scientific™ Orbitrap™ 质量分析仪与高容量传输管和电动离子漏斗耦合,以最大限度地提高离子在很宽的质量范围内加载和传输离子。因此,该仪器可提供明亮、聚焦且富含离子的光束,从而在每次运行中转化为高灵敏度和出色的分析质量稳定性。智能仪器控制功能将卓越的离子传输与更高的采集速度以及更复杂的数据相关采集和分析策略相匹配,以满足您工作每个阶段的数据质量需求,从发现到验证和定量
特征
采用 Thermo Scientific 分段 HyperQuad 的先进四极杆技术
超高场 Orbitrap 分析仪,速度和分辨率翻倍,分辨率高达 240,000
最大扫描速度 40 Hz
用于增强占空比的频谱复用
高容量传输管和电动离子漏斗源可提高灵敏度
用于高通量离子源的高级主动束引导智能离子束管理
数据采集
使用Proteome Discoverer(版本 2.1.0.81,Thermo Scientific)处理原始数据文件。使用搜索引擎SequestHT搜索数据。我们还使用_cc781905-5cde-3194-bb3b- 136bad5cf58d_MaxQuant 、 Perseus和Skyline包进行数据处理和审查。
提供的服务类型
蛋白质鉴定
一种以肽为中心(自下而上)的方法,使用 nanoLC-MS/MS 和多种碎裂模式(CID、HCD、ECD)来鉴定肽的氨基酸序列。 来自溶液或聚丙烯酰胺凝胶的样品使用胰蛋白酶消化(可用的替代酶);肽被纯化、浓缩并加载到 nanoLC C18 分析柱上。
完整的质量测量
完整质量测量可用于确认纯化蛋白质的序列或评估配体与纯化蛋白质的结合。根据我们的经验,完整的质量测量对于确定未知抗体序列是非常宝贵的。
蛋白质作图 - 蛋白质序列 确认
蛋白质图谱可以通过使用三种酶进行消化来识别蛋白质的整个序列。该服务非常适合识别单独胰蛋白酶无法进入的感兴趣区域、确认一级序列或寻找截断。这里介绍了基本的实验工作流程
定量蛋白质组学
相对定性和定量方法表明同一样品中的蛋白质水平以及样品之间的差异水平。此类别中存在多种方法。现代蛋白质组学表明蛋白质鉴定只是难题的一部分,并且越来越有必要了解蛋白质在细胞整体环境中的表达谱。存在多种解决方案,其中一些解决方案比其他解决方案更准确、更强大和更适用。我们的实验室拥有多种方法的经验,包括.
无标签
串联质量标签 (TMT)
平行反应监测 (PRM)
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下载样本提交表(蛋白质组学)